Seminar 2025/2026

Skupine in termini

Seminar se izvaja v treh skupinah:

oznaka	termin v učilnici	rok za oddajo	rok za reševanje
S1	2026-05-07 (13.00–16.00)	2026-05-11 (do 12.00)	2026-05-28 (do 12.00)
S2	2026-05-08 (10.00–13.00)	2026-05-12 (do 12.00)	2026-05-28 (do 12.00)
S3	2026-05-13 (13.00–16.00)	2026-05-17 (do 12.00)	2026-05-28 (do 12.00)

Poimenska razporeditev v skupini je objavljena v spletni učilnici UL FKKT pod predmetom Biokemijska informatika.

---

Splošne informacije

Naloga vsakega posameznika je, da:

• pripravi nalogo s področja biokemijske informatike (kot da bi pripravljali nalogo za vaje ali kolokvij v razširjeni obliki) – nalogo začnete pripravljati v okviru ‘termina v učilnici’ (glejte tabelo zgoraj), dokončate doma, ter jo oddate do ‘roka za oddajo’ (glejte tabelo zgoraj);

• pripravi rešitev te naloge, ki jo prav tako odda do ‘roka za oddajo’ (glejte tabelo zgoraj);

• reši njemu dodeljeno nalogo, ki jo je sestavil kolega (dodelitev bo 2026-05-20) in do ‘roka za reševanje’ odda rešitev, komentar in izpolni anketo.

Vsak torej pripravi nalogo s področja biokemijske informatike ob upoštevanju na vajah in predavanjih obravnavane snovi (torej ne nujno zgolj na vajah obravnavane snovi!) ter spremljajočo rešitev te naloge z razlago (v ločeni datoteki). Naloge, ki jih boste ustvarili člani ene skupine, bodo naključno dodeljene članom iz druge skupine (in obratno), ki jih bodo morali rešiti, nato primerjati svojo rešitev z dokumentirano rešitvijo avtorjev naloge, svoje mnenje pa bodo posredovali preko spletne ankete (povezava do ankete bo dodana kasneje).

Razmišljanje o pripravi naloge

O tem, kakšno nalogo boste pripravili, lahko seveda začnete vsaj približno razmišljati še pred vašim terminom v računalniški učilnici.

Opravljen seminar in ocena

Da se bo seminar upošteval kot opravljen mora vsak opraviti vse tri naloge, navedene pod ‘Splošne informacije’ zgoraj.

Naloge se sicer ne bodo ocenjevale oz. vsaka naloga ne bo dobila ocene, bodo pa avtorji do največ desetih najboljših nalog (po presoji predavatelja) nagrajeni z dodatkom pri končni oceni predmeta in sicer v višini +5 % (prišteje se h končni oceni, izračunani iz uspešno opravljenega kolokvija in izpita).

Navodila za pripravo nalog in rešitev

Vaša naloga je torej sestavljena iz dveh delov:

1. Zamislite si morate nalogo ter jo zapisati na način, da bo reševalec(ka) dobil vse potrebne podatke zareševanje.

2. Posebej pripravite rešitev te naloge in jo pospremite z razlago.

Koraki

1. Prenesite Markdown datoteko s predlogo (desni klik -> shrani kot …), jo ustrezno preimenujte (npr. S#-##.md pri čemer je S# oznaka seminarskega termina (S1, S2, S3), ## pa številka računalnika (od 01 do 15)), iz nje pobrišite komentarje in zapišite nalogo. Primer imena: S2-05 (2. termin, 5. računalnik).

2. Pripravite Word datoteko, jo poimenujte kot S#-##-resitev.docx (to je primer imena, vezan na prejšnjo točko), v njej pa pripravite rešitev naloge, dodajte zaslonske slike ipd.

3. Po potrebi lahko pripravite še dodatne spremljevalne datoteke kot del rešitve, če je to potrebno (poimenujte jih po ključu S#-##-resitev-vsebina.koncnica, pri čemer besedo vsebina nadomestite s kratkim opisom, koncnica pa s končnico, npr. pdb).

4. Word datoteko shranite kot PDF, npr. S#-##-resitev.pdf.

5. Prepričajte se, da ste datoteke res ustrezno poimenovali.

6. Datoteke oddajte preko posebne povezave v spletni učilnici (razdelek ‘Seminar’). Word datoteke ni potrebno oddajati, dovolj je PDF. Datoteke morate oddatido navedenega roka.

V datoteko z nalogo ne zapisujte vaših imen!

Poimenovanje datotek

Na primer, nekdo na 2. terminu pri 7. računalniku bi oddal naslednje datoteke:

• S2-07.md (obvezno),

• S2-07-resitev.pdf (obvezno),

• S2-08-resitev-model.pdb.

Pri poimenovanju datotek upoštevajte smernice, navedene tukaj.

Smernice

Pri pripravi naloge upoštevajte smernice:

• Naloga mora biti rešljiva.

• Naloga ne sme biti preveč enostavna, hkrati pa ne preobsežna ali prezahtevna – od povprečnega reševalca mora zahtevati približno 90 min časa.

• Potrudite se, da bo naloga čim bolj zanimiva. Lahko je recimo povezana s kakšnim člankom ali aktualnim problemom.

• Za idejo, kako zapisati zanimivo nalogo, malce pomislite na naloge, ki ste jih dobili na kolokviju. Seveda mora biti vaša naloga kompleksnejša.

• Naloga naj bo rešljiva z uporabo zbirk in orodij, dostopnih preko spleta (podobno kot na vajah).

• Če reševanje naloge zahteva uporabo programa, ki ga niste uporabljali na vajah (npr. orodje za identifikacijo genov v zaporedjih, identifikacija intronov, napoved neurejenih regij, …), lahko na to namignite v nalogi. Podajte tudi kratka navodila za uporabo oz. povezavo do ustreznih navodil.

Pri pripravi rešitve upoštevajte smernice:

• Jasno navedite vse korake, potrebne za rešitev naloge, ter jih razložite.

• Navedite morebitne alternativne rešitve in jih pokomentirajte.

• Vključite zaslonske slike, ko dokumentirajo proces reševanja ter vmesne in končne rezultate. Opremite jih s komentarji oz. naslovi, da bo jasno, kaj je na posamezni sliki prikazano. Prav tako se na slike naslavljajte v opisu postopa reševanja.

• Če je potrebna uporaba spletnega programa (ali zbirke), ki ga niste uporabljali na vajah, posebno pozornost namenite opisu tega programa (kako se uporablja, interpretacija rezultatov). Dodate lahko tudi povezave do spletne pomoči ipd.

Naloge za reševanje

Razpored nalog za reševanje bo na voljo 2026-05-20.