Contents

# S2-10

- **Datum izdelave**: (2026-05-011) - **Koda seminarja**: (S2-10)

## Naloga

Klebsiella pneumoniae je enterobakterija. Pogosto je prisotna v črevesni flori ljudi, kjer običajno ne povzroča težav, vendar pa so nekateri sevi patogeni in lahko povzročajo različne okužbe (okužbe dihal, sečil in ledvic, krvi, ran in mehkih tkiv), zlasti pri ljudeh z oslabljenim imunskim sistemom ali drugimi zdravstvenimi težavami. Nekateri sevi Klebsiella pneumoniae so postali odporni na več različnih antibiotikov (MDR), kar predstavlja izziv pri zdravljenju okužb, ki jih povzročajo ti sevi. Eden izmed vrst enciomov, ki omogočajo rezistenco bakterij proti antibiotikom so ESBL - extended spectrum beta-lactamase.

  1. Rezistenco proti katerim antibiotikom omogočajo ti encimi? Kakšen je njihov način delovanja?

  1. Poišči ESBL Escherichia coli in Pseudomonas aeruginosa. Ali je aktivno mesto laktamaze pri vseh treh enako? Kako pa je z vezavnim mestom za beta-laktam?

  1. Za extended spectrum beta-lactamase OXA naredi model (SWISS MODEL/Alpha Fold…) ter ga primerjaj z dobro anotiranim ESBL proteinom Klebsiella pneumoniae. Kakšne razlike/podobnosti opaziš. Primerjaj še z strukturo ESBL iz Escherichia coli in Pseudomonas aeruginosa.

  1. Ali bi lahko ESBL OXA in dobro anotirani ESBL K. pneumoniae ločil z anionsko izmenjevalno kromatografijo? Razloži

  1. Pod katalitično aktivnostjo imaš ID za spletno orodje Rhea, ki podaja podrobnejši opis reakcij. V koliko reakcijah je še vključen a β-laktam? Koliko proteinov katalizira to reakcijo? (Namig: S pomočjo ChEBI kode, ki jo lahko najdeš pri reakciji v Uniprotu, poišči reakcijo, ki opisuje hidrolizo β-laktamskega obroča)

  1. Določi še funkcijo karbapenemaze. V katero družino spada ta protein?

  1. Primerjaj aktivno in vezavno mesto karbapenemaze in ESBL(ChimeraX). Ali sta proteina homologa (preveri z BLAST)?

Contents