Razredi

Razredi#

Razred \(\alpha\)#

Obvite vijačnice (coiled-coils)
../_images/razred_alfa-obvite_vijacnice.png

Obvite vijačnice (coiled-coils) so pogost način pakiranja \(\alpha\) vijačnic v različnih proteinih. Tukaj je prikazan primer homodimera dveh vijačnic transkripcijskega faktorja GCN4 (PDB 2ZTA) iz kvasovke Saccharomyces cerevisiae, kjer je lepo razvidna levcinska zadrga, v katero so vključeni tudi valinski ostanki. Zadrga je v sredini prekinjena s parom Asn–Asn, pri sestavljanju dimera pa so pomembne tudi ionske interakcije med nasprotno nabitimi stranskimi skupinami Asp/Glu ter Lys/Arg (dejansko gre za solni mostiček). Nezanemarljive niso niti hidrofobne interakcije med C\(\gamma\) in C\(\delta\) Lys in Leu/Val v sredici dimera.

Povezave
../_images/razred_alfa-obvite_vijacnice-qr.png
Snop 4 \(\alpha\) vijačnic
../_images/razred_alfa-snop_4_vijacnic.png

Homodimer proteina ROP iz bakterije Escherichia coli (PDB 1ROP) je klasičen primer snopa 4 vijačnic, pri katerem je lepo razvidno hidrofobno pakiranje.

Povezave
../_images/razred_alfa-snop_4_vijacnic-qr.png