\# S2-10

\- \*\*Datum izdelave\*\*: (2026-05-011) - \*\*Koda seminarja\*\*:
(S2-10)

\## Naloga



>Klebsiella pneumoniae je enterobakterija. Pogosto je prisotna v
črevesni flori ljudi, kjer običajno ne povzroča težav, vendar pa so
nekateri sevi patogeni in lahko povzročajo različne okužbe (okužbe
dihal, sečil in ledvic, krvi, ran in mehkih tkiv), zlasti pri ljudeh z
oslabljenim imunskim sistemom ali drugimi zdravstvenimi težavami.
Nekateri sevi Klebsiella pneumoniae so postali odporni na več različnih
antibiotikov (MDR), kar predstavlja izziv pri zdravljenju okužb, ki jih
povzročajo ti sevi. Eden izmed vrst enciomov, ki omogočajo rezistenco
bakterij proti antibiotikom so ESBL - extended spectrum beta-lactamase.



>1. Rezistenco proti katerim antibiotikom omogočajo ti encimi? Kakšen
je njihov način delovanja?



>2. Poišči ESBL Escherichia coli in Pseudomonas aeruginosa. Ali je
aktivno mesto laktamaze pri vseh treh enako? Kako pa je z vezavnim
mestom za beta-laktam?



>3. Za extended spectrum beta-lactamase OXA naredi model (SWISS
MODEL/Alpha Fold...) ter ga primerjaj z dobro anotiranim ESBL proteinom
Klebsiella pneumoniae. Kakšne razlike/podobnosti opaziš. Primerjaj še z
strukturo ESBL iz Escherichia coli in Pseudomonas aeruginosa.



>4. Ali bi lahko ESBL OXA in dobro anotirani ESBL K. pneumoniae ločil z
anionsko izmenjevalno kromatografijo? Razloži



>5. Pod katalitično aktivnostjo imaš ID za spletno orodje Rhea, ki podaja podrobnejši opis reakcij. V koliko reakcijah je še vključen a β-laktam? Koliko proteinov katalizira to reakcijo? (Namig: S pomočjo ChEBI kode, ki jo lahko najdeš pri reakciji v Uniprotu, poišči reakcijo, ki opisuje hidrolizo β-laktamskega obroča)



>6. Določi še funkcijo karbapenemaze. V katero družino spada ta protein?



>7. Primerjaj aktivno in vezavno mesto karbapenemaze in ESBL(ChimeraX).
Ali sta proteina homologa (preveri z BLAST)?