Raziskovanje ACE2

Pandemija COVID-19, ki jo je povzročil virus SARS-CoV-2, je močno pretresla sodobno družbo in znanost. V središču raziskav, povezanih z virusom, se je znašel humani protein ACE2 (ang. angiotensin-converting enzyme 2), saj predstavlja glavni receptorski vhod virusa v človeške celice. Ravno vezava virusovega “Spike” proteina na ACE2 omogoči začetno okužbo in vstop virusa v celico. ACE2 pa ima tudi pomembno fiziološko funkcijo pri uravnavanju krvnega tlaka, saj sodeluje v renin-angiotenzinskem sistemu.

1. Zapišite uniprot ID in dolžina proteina in kje se izraža (v katerih tkivih) ter biološko funkcijo.

2. Zapišite molsko maso in izoelektrično točko, ugotovite ali je protein hidrofoben ali hidrofilen.

3. Naštejte domene, ki ih ima protein in katere družine proteinov vsebuje.

4. Poiščite homologe proteine in ali ima miš tudi homolog?

5. Poiščite članek, ki opisuje med ACE2 in Covid-19, katerga regija ACE2 omogoča vezavo proteina virusa?

6. Poiščite ACE2 v kompleksu z SARS-COV2 spike proteini in določi, katere verige so določene v kompleks.

7. Poiščite aminokislinska mesta, ki so v stiku z virusnim Spike proteinom, kaj bi pomenile mutacije v teh regijah za vezavo virusa.